據央視新聞報道，1989年7月，大量人骨在位於東京新宿的一處施工現場被發現，施工現場是原日本陸軍軍醫學校所在地，侵華日軍731部隊大本營被認為就設在該校內。 日本民間人士於1990年成立了「調查軍醫學校舊址所發現人骨問題協會」，以推動調查真相。
近日，該協會和部分民眾在陸軍軍醫學校舊址及周邊進行實地考察活動。他們認為，這些人骨可能與戰爭犯罪有關，並要求日本政府展開徹查。該協會認為，這些人骨在日本陸軍軍醫學校舊址，也被認為是侵華日軍731部隊的大本營被發現，因此極有可能與731部隊的人體實驗有關。
「調查軍醫學校舊址所發現人骨問題協會」事務局長鳥居靖：正式公布的是62具人骨，但實際上數量更多。這裏可以看到有刀傷痕迹；這裏可以看出有傷口，像是頭部遭受打擊；這是槍傷痕迹，這個槍傷被鑒定是死後的槍傷，可能死後被做過子彈穿顱實驗。為什麼知道是死後的實驗呢？前面是子彈射入口，後面的子彈射出口這麼大，如果大腦不是死後乾燥情況下，就不會出現這樣的差異。這些照片都是人骨照片，這個照片很明顯是被鋸斷的大腿骨，為什麼被鋸斷呢？理由不知道。
2001年，日本厚生勞動省曾發布調查報告稱，施工現場發現的人骨是標本，有證言否定人骨來自日本國外，厚生勞動省表示無法斷定人骨與731部隊存在關聯。但「調查軍醫學校舊址所發現人骨問題協會」認為僅僅根據證言得到的判斷不夠嚴謹，日本政府應該繼續進行更徹底的鑒定和調查，但政府卻以各種理由搪塞拒絕。
「調查軍醫學校舊址所發現人骨問題協會」成員 吉田守：3月25日我們又去厚生勞動省，要求進行徹查，得到的回答依然是只要沒有確定這些人骨與731部隊有關，就不進行調查。但是我們認為，日本政府就這些人骨的來歷展開徹查才是正確的態度。
日本民間團體和民眾表示，二戰時期日軍犯下的罪行不應被掩蓋，日本政府應該就發現的人骨進行科學鑒定與調查，讓後代了解歷史真相，不再重蹈戰爭覆轍。
當地居民 村田真由美：很多歷史真相我們日本人都不知道。做學生的時候，關於戰爭、戰爭責任、真相等，對學校所教的內容都信以為真。但當我長大成人後，聽到健在的戰爭親歷者證言才知道，學校里教的很多都不是事實。所以希望學校教給我們正確的歷史，我希望能了解歷史的真相。
「調查軍醫學校舊址所發現人骨問題協會」事務局長鳥居靖：不僅是人骨問題，日本政府對於戰爭時期的殘暴行徑基本都沒有承認，特別是關於731部隊。雖然承認731部隊的存在，但對於731部隊的非人行徑從未承認。即使有這麼多確鑿的證據，但仍然聲稱沒有資料，遮遮掩掩。我認為如果日本不承認戰爭時期的殘暴行徑，日中之間不可能建立真正的友好。我認為日本政府應該以正確的態度對待這段歷史。
