深圳科研項目登《自然》封面
圖:深圳華大基因研究成果登上《自然》封面(nature.com)
【本報記者王一梅深圳四日電】最新出版的國際頂尖科學期刊《自然》以封面故事着重介紹了由中國深圳華大基因研究院主要承擔的「人體腸道菌群元基因組參考基因集的構建工作」。該研究屬於歐盟第七框架資助項目──人體腸道元基因組研究計劃(MetaHIT)的一部分,得到了國家科技部國際合作司和深圳市的配套支持。深圳華大基因研究院作為唯一的非歐盟研究團體參與到MetaHIT計劃中,採用高通量的測序技術和高效能的信息分析平台,取得了一系列突破性的研究成果。
人體除受自身基因的調控外,還受到大量的共生細菌的影響。這些細菌大部分寄生在人的腸道中,通稱為腸道菌群,在學術界常被稱作「人體腸道元基因組」。該項研究成果收集了124個來自於歐洲人腸道菌群的樣本,採用了新一代大規模高通量的測序技術進行深度測序,產出近6千億的鹼基序列。經過序列組裝和基因註釋分析,從中獲得330萬個非冗餘的人體腸道元基因組的參考基因,約是人自身基因的150倍。這個基因集中包含了絕大部分目前已知的人體腸道微生物基因,但更多的是目前未知微生物的基因。從這個基因集中可以估計人腸道中存在約1000到1150種細菌,平均每個體內約含有160種優勢菌種,並且這些細菌是絕大部分個體所共有的。
研究證實,不當的飲食會導致腸道菌群的結構失衡,進而引發的慢性炎症是造成這些代謝性疾病的主要因素。但具體是哪些菌群的結構失衡,以及它們如何引發慢性炎症,對這些問題的回答現在仍處於猜測階段。人體腸道元基因組參考基因集的構建,加深了人們對腸道微生物與人體自身健康關係的理解。
據了解,在此項研究成果的基礎上,深圳華大基因研究院與MetaHIT計劃的眾多合作單位一起,正在開展更深入的研究以揭示腸道菌群的基因組成與肥胖、腸炎病的關係。