【科學講堂】「從二維到三維」揭秘病毒外殼組裝過程
病毒是一種奇異的物質:感覺上它們是活的,但卻並不符合我們對生物的定義——它們沒有細胞結構,也無法自行繁殖。病毒蛋白質外殼的奇異程度也不遑多讓,在合適的環境下,這個蛋白質外殼可以由零碎的部件自行組成,而在適當的刺激之下它又能夠化整為零,變回分開的部件。病毒的體型本來已經十分微小,它們的外殼以及組成的部件自然就更為微細,因此要直接觀察這些部件組成外殼的過程,一直以來都是一個難題。近日研究人員成功觀察到這個過程,幫助我們了解病毒外殼組成背後的原理。
理解病毒外殼組成的原理,亦可以帶來醫學上的益處。病毒外殼的構造過程極其精細微妙:組成部件之間的吸引力如果太弱,就無法構成穩固的外殼;假如吸引力太強,又不能方便地將遺傳物質釋放出來,甚至會把它們壓得變形。正因如此,外殼蛋白質的一點點變異,就會讓病毒無法生存。
若能以「仿生」的思路,借鑒病毒外殼來包裹藥物,就能令其到合適的地方再釋放出來,更有效地發揮效用。
以往曾有研究團隊運用高速的原子力顯微掃描,去實時觀察病毒蛋白質如何組合起來,甚至修補附近結構上有缺陷的地方。不過,這個方法只能夠應用到平面上的蛋白質結構,因此不能用來觀察整個立體蛋白質外殼的組成。另有一些研究團隊曾經利用質譜分析法,希望量度在病毒外殼組成的過程中,不同中間狀態的質量。
不過,最後發現,這個方法只能夠量度到剛開始組成或快要完成的病毒外殼的質量。研究人員也嘗試運用X光去測量病毒外殼的組成,可惜只能夠成功觀察到組成過程中的幾個步驟,未能對整個組成過程形成全面認知。
今次要介紹的研究則使用了一種「從二維到三維」的方式觀察病毒外殼的形成過程。
首先,利用脂質膜和組氨酸標籤的相互作用,將帶有標籤的蛋白亞基錨定在二維膜表面,以誘導形成關鍵的成核中間體。
然後,向體系中加入不帶標籤的自由蛋白亞基,它們以膜上的成核中間體為「種子」,繼續組裝並延伸至三維空間,形成完整病毒外殼。
最後,研究人員通過質量光子學(MP) 等技術監測過程中的時間和質量變化,推斷出病毒外殼的組裝過程。
這次的研究發現,外殼部件之間的吸引力其實較弱,而組合的開始過程很視乎這些部件能夠移動得有多快。而且以五邊形作為每個平面的基本形狀,看來可以造成較堅固的外殼。這些發現都增進了我們對病毒外殼組成的理解。
總而言之,這次談及的研究,為理解病毒外殼打開了一個新的方向。不過這個研究專注只運用一種組成部件,而且需要在一個平面的脂質膜上開始。雖然相類的原理應該在其他的狀況中也會適用,研究人員還需進一步探索其他的情境。
●杜子航 教育工作者 早年學習理工科目,一直致力推動科學教育與科普工作,近年開始關注電腦發展對社會的影響。