打破常規/不應被「高影響因子期刊」綁架
蒲慕明談到，隨着中國的研究環境逐漸提升，中國基礎研究機構快速擴張，在國際期刊上發表的文章也得到了快速增長。但這種增長往往以文章數量而不是質量來進行衡量的。「這是一個嚴峻的問題，我們的每個實驗室都得到了政府的大量資助，但與科技發達國家相比，具有國際影響力的高水平論文卻相當少。」
蒲慕明坦言，許多年輕科學家都為在高影響因子期刊上發表文章花費了太多精力，也承受着巨大的壓力。許多有天分的年輕科學家，特別是生命科學領域的年輕科學家，正遭受着「高影響因子期刊」和「研究機構要求」的雙重詛咒。「為了在這些所謂的高影響因子期刊上發表文章，學者往往需要遵循被同行廣泛接受的範式與思想。但是，創新的科學常常需要打破領域中的既有範式。我們需要為打破常規的科學思想提供可以蓬勃發展的科研制度與研究氛圍。」
鼓勵發表原創性研究成果
近年來，蒲慕明多次強調，要建立新的出版途徑發表那些可能不被高影響因子雜誌接受的創新性研究成果，並建立新的、重視研究原創性的評價標準。他也親自擔任《國家科學評論》──我國一份英文版自然科學綜述性學術期刊的執行主編。「我們在《國家科學評論》上發表許多原始研究論文，希望發表的工作在滿足嚴格科學標準的同時，可以不一定符合領域內的主流範式。」
蒲慕明深知，20年前才起步的中國神經科學現在還是一個蹣跚學步的孩子，需要抓緊每時每刻不斷成長。他曾給學生寫過一封郵件，被廣為稱道。他在其中提到，學生必須把心思花在研究上，每周要在實驗室工作6天。「為什麼要嚴苛的時間規定，就是要強調專注精力，及早獲得成果。有了成果，就可以建立信心，在科研上越做越好。」
