【科學講堂】研白堊紀恐龍細胞 揭生化分子交叉鏈接

●圖為霸王龍頭骨化石。 資料圖片
●圖為霸王龍頭骨化石。 資料圖片

●圖為中國科學家團隊在東北發現的尾羽龍腿骨,其中保存有完好的軟骨細胞。 網上圖片
●圖為中國科學家團隊在東北發現的尾羽龍腿骨,其中保存有完好的軟骨細胞。 網上圖片

  要更深入了解生命在歷史長河中的起源和演化,很需要依賴遠古時代遺留下來的生物樣本,因而極容易受制於這些生物樣本可以在大自然的環境中保存多久。生物堅硬的部分(例如骨頭、甲殼)可以轉化成化石,因此能夠留存下來讓我們繼續研究,但是血管、蛋白質這一類的軟組織,有可能留傳數千萬、數億年供現在的我們深入分析嗎?這次就和各位分享一下。

  從1980年代到2000年左右,已有多個各自獨立的研究指出,蛋白質在一些特定的環境下可以保存數百萬年。相比之下,DNA、RND等核酸在生物死亡數十萬年之後,就會經由水解這一過程而分解。

  如此看來,要利用古舊的DNA來研究恐龍之類的史前生物是不太可能的了。學者們善用實驗得來的數據,開發了理論模型去描述生化分子分解的時間和速度。根據這個模型的預測,組成血管、細胞、纖維組織的蛋白質、脂肪和醣類等等,應該不可能在來自中生代(距今兩億五千二百萬至六千五百萬年)的化石中保留下來,更遑論源於古生代(距今五億三千八百萬至兩億五千二百萬年)的化石。

  不過到了2005年,有研究發布了正面的發現:在北美蒙大拿的地獄溪層(英語:Hell Creek Formation)中發掘出霸王龍和鴨嘴龍的骨頭,當中發現大量有彈性、柔韌、半透明的細胞和血管結構被保存下來。

  這些細胞可以追溯至白堊紀晚期(距今一億至六千六百萬年),與之前提及的理論模型預測的結果並不相符。研究人員運用光學和電子顯微鏡,可以觀察到類似骨細胞的構造、表面有細胞核痕跡的血管。這些結構都跟現代的鴕鳥骨有相似之處。

  推論與實際產生矛盾?

  研究人員更利用專門針對鳥類蛋白質的抗體,發現這些抗體對恐龍樣本收集到的蛋白質也會發生生化作用。這代表這些恐龍蛋白質還保存了立體的結構,否則不可能與抗體有任何相互作用。

  這樣的研究成果讓很多人興奮,但也引發了不少的懷疑。有學者指出研究使用的抗體可能不只限於跟鳥類蛋白質有「互動」,而實驗樣本也有可能被現代的蛋白質污染了。

  生化學家們還討論,蛋白質的結構是否可以熬過這麼長的時間?特別是經歷過地獄溪層攝氏40度的環境——普遍而言,攝氏40度會破壞蛋白質的構造和本質。亦有學者因而考慮,我們用來預測生化分子分解的模型是否遺留了什麼重要的部分?

  交叉鏈接形成屏障保護生化分子

  到了2018年至2019年,研究人員發現生化分子之間或內部可以構成額外的化學鍵,好比有更多的支架,進一步鞏固了生化分子的結構。這個現象叫作交叉鏈接。交叉鏈接可以擔起屏障的功用,保護其他化學結構較不穩定的生化分子,減慢它們被分解的速度,繼而解釋了這些生化分子可以保存很久的原因。

  小結

  今次分享了生化分子研究構成中結論不斷更新、發展的故事。在科學研究中,我們不時會遇到好像相互矛盾的現象,在找到背後原因的過程中,又能夠開拓一個新的領域,增進我們的發展。

  ●杜子航 教育工作者

  早年學習理工科目,一直致力推動科學教育與科普工作,近年開始關注電腦發展對社會的影響。